Almanya'nın Freising yapılan kura töreninde, doğrudan katılan 28 takım ile eleme turundan gelecek 4 takım, 4'erli 8 gruba ayrıldı.
Gruplara doğrudan katılan Pınar Karşıyaka, (A) Grubu'nda KRKA Novo Mesto (Slovenya), ETHA Engomi Nicosia (Kıbrıs Rum kesimi), ve TOFAŞ-Rakvere Tarvas maçının galibi ile eşleşti.
Ön eleme maçları yapacak Aliağa Petkim ve TOFAŞ'ın rakipleri de belli oldu. Buna göre Aliağa Petkim, Finlandiya'dan Joensuun Kataja, TOFAŞ ise Estonya'dan Rakvere Tarvas ile ön eleme maçı oynayacak.
FIBA EuroChallenge Kupası'nda gruplar şöyle oluştu:
(A) Grubu: KRKA Novo Mesto (Slovenya), Pınar Karşıyaka (Türkiye), ETHA Engomi Nicosia (Kıbrıs Rum kesimi), TOFAŞ-Rakvere Tarvas maçının galibi.
(B) Grubu: Aliağa Petkim-Joensuun Kataja maçının galibi, Krasnye Krylia Samara (Rusya), Keravnos Nicosia (Kıbrıs Rum kesimi), CSU Asesoft Ploiesti (Romanya)
(C) Grubu: Sodertalje BBK (İsveç), BK Ventspils (Letonya), Norrkoping Dolphins (İsveç), Tampereen Pyrintö (Finlandiya)
(D) Grubu: Ural-Metan maçının galibi, Khimik Yuzhny (Ukrayna), University Tartu (Estonya), JDA Dijon (Fransa)
(E) Grubu: BCMU Pitesti (Romanya), Belfius Mons-Hainaut (Belarus), Okapi Aalstar (Belarus), Paris Levallois (Fransa)
(F) Grubu: BC Timisoara (Romanya), Szolnoki Olaj (Macaristan), EWE Baskets Oldenburg (Almanya), Fortress-Lami Ved Körmend (Macaristan)
(G) Grubu: Apollon-Xion maçının galibi, Gravelines Dunkerque (Fransa), BC Minsk 2006 (Belarus), SLUC Nancy (Fransa),
(H) Grubu: Hapoel Holon (İsrail), Port of Antwerp Giants (Belçika), Telekom Baskets Bonn (Almanya), BC Armia Tbilisi (Gürcistan).
